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党委的参谋和办事机构，负责落实学校党的思想建设、组织建设、作风建设、制度建设和反腐倡廉的具体工作。围绕学校中心工作，做好组织协调、公文处理、联络接待、信息公开、机要保密、重要会议及活动组织等综合管理服务工作。

结合学校发展战略，统筹研究生教育管理和质量保障工作。负责学位授权点建设及研究生教育项目建设，负责研究生招生录取、培养过程、学籍与奖助、学位授予等的管理与服务工作。

学生事务处围绕学校人才培养目标，为学生综合素质培养提供全面的支撑和服务。

科技发展处是全校科学研究和科技创新能力建设工作的主管业务部门，负责学校科研规划、政策制定；负责推进科教融合、产教融合工作等。

跨界引领创新创业生态，营造创新创业氛围，运营自主知识产权，孵化早期技术和初创企业，促进创新创业的实践教育，扩大创新创业对产业和经济的影响力，践行学校使命，做出时代贡献。

围绕学校办学理念来开展各项国际交流和事务。负责统筹协调管理学校国际合作项目；组织校级外事接待和海外交流活动；负责学校涉外宣传工作等。

负责全校财务管理工作和审计管理工作: 会计核算和审核监督、编制预算和收支计划、参与经费和资产相关议题讨论、制定财会制度和标准等。

公共服务处旨通过“校园服务中心”的窗口平台，统筹各类资源资产的潜能、提升各类配套服务的能级，结合信息化、智能化管理手段，为广大教职员工和学生提供后勤保障服务、营造舒适便捷的学习生活环境、打造温馨优质的校园公共空间。公共服务处的管理范围包括: 楼宇物业、餐饮住宿、能源中心、交通保障、配套服务、治安消防、快递物流、体育设施、会务接待、活动赛事、环境绿化、医疗健康等。

承担上科大基建项目计划、立项和项目前期工作；负责上科大建设项目组织实施与管理工作。

设备与资产处是学校设备资产采购和管理的职能部门，紧紧围绕学校的发展战略，承担起全校的设备资产采购和管理的任务，以制度建设和信息化建设为抓手，统筹安排、扎实推进，为建设“小规模、高水平、国际化”的研究型、创新型大学提供坚实的物质基础和管理保障。